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Veja a composição do Conselho de Administração, Diretoria Executiva, Conselho Fiscal e Comitê de Elegibilidade neste link externo: www.epagri.sc.gov.br/index.php/a-epagri/administracao/
As atribuições dos administradores (membros da Diretoria Executiva e Conselho de Administração), Conselho Fiscal, Comitê de Elegibilidade e Comitê de Compliance constam no Estatuto Social e no Regimento Interno.
Diretoria Executiva (administração atual)
| Nome | Cargo | Ato de nomeação | Data de início do mandato | Data prevista para término do mandato |
| Dirceu Leite | Diretor-Presidente | 95ª Reunião Extraordinária do Conselho de Administração; 114ª Reunião Extraordinária do Conselho de Administração | 27/03/2023 | 30/05/2027 |
| Fabrícia Hoffmann Maria | Diretora Administrativo-Financeira | 96ª Reunião Extraordinária do Conselho de Administração; 114ª Reunião Extraordinária do Conselho de Administração | 26/04/2023 | 30/05/2027 |
| Gustavo Gimi Santos Claudino | Diretor de Extensão Rural e Pesqueira | 96ª Reunião Extraordinária do Conselho de Administração; 114ª Reunião Extraordinária do Conselho de Administração | 26/04/2023 | 30/05/2027 |
| Andreia de Fátima de Meira Batista Ferreira Schlickmann | Diretora de Ensino Agrotécnico | 111ª Reunião Extraordinária do Conselho de Administração; 114ª Reunião Extraordinária do Conselho de Administração | 20/01/2025 | 30/05/2027 |
| Jurandi Teodoro Gugel | Diretor de Desenvolvimento Institucional | 114ª Reunião Extraordinária do Conselho de Administração | 30/05/2025 | 30/05/2027 |
Histórico de ex-Presidentes
| Nome | Data de início do mandato | Data de término do mandato |
| Loris João Basso | 20/03/1991 | 26/09/1991 |
| Fernando César Granemann Driessen | 20/11/1991 | 02/07/1992 |
| Antônio Mário Scherer | 02/07/1992 | 03/01/1995 |
| Adolfo Nunes Corrêa | 04/01/1995 | 29/01/1996 |
| Joel Vieira de Oliveira | 29/01/1996 | 26/01/1997 |
| Rogério Mendonça | 27/01/1997 | 31/03/1998 |
| Valdir Crestani | 31/03/1998 | 03/01/1999 |
| Dionísio Bressan Lemos | 04/01/1999 | 05/01/2003 |
| Athos de Almeida Lopes | 06/01/2003 | 01/01/2007 |
| Murilo Xavier Flores | 02/01/2007 | 04/02/2009 |
| Luiz Ademir Hessmann | 05/02/2009 | 06/02/2019 |
| Edilene Steinwandter | 07/02/2019 | 31/03/2022 |
| Giovani Canola Teixeira (Interino) | 01/04/2022 | 31/05/2022 |
| Giovani Canola Teixeira | 01/06/2022 | 24/10/2022 |
| Edilene Steinwandter | 24/10/2022 | 20/03/2023 |